Đó là một ngày đẹp trời tại quận Ijincho, thành phố Yokohama, Nhật Bản. Đội cứu hỏa nhận được tin báo có cháy tại một ngôi nhà hoang. Các lính cứu hỏa tiến vào trong và cho rằng các biểu hiện nhìn từ bên ngoài đã có thể nhận ra đây là một vụ cháy giả được tạo để trêu cảnh sát.
Tuy nhiên lần này những người lính cứu hỏa cảm thấy lạ lùng, các thanh pháo sáng dùng để tạo khói được xếp thành một mũi tên chỉ thẳng vào một khối được phủ bạt gần tường nhà. Khi những người lính cứu hỏa kéo bạt ra thì phát lộ một xác chết đã phân hủy nặng bị trói trên ghế.
Quay trở lại khu Kamurocho quen thuộc, đã 3 năm trôi qua kể từ vụ án nổi tiếng của thám tử Yagami. Anh đã khám phá ra một vụ bê bối lớn liên quan đến bộ Y Tế và khiến cả dàn lãnh đạo bộ này cùng các tổ tức Yakuza có dính líu sụp đổ hoàn toàn. Yagami nhận được một cuộc điện thoại từ người quen cũ ở vụ án trước là Fumiya Sugiura, anh ta cùng với gã chuyên gia máy tính Makoto Tsukumo đã lập một văn phòng thám tử riêng tại khi Ijincho, thành phố Yokohama. Sugiura và Tsukumo lần lượt điện thoại mời Yagami và Kaito đến chỗ của mình và giúp họ trong 1 vụ cần nhiều người tham gia giải quyết.