Quay trở lại chỗ Jonah, Lara thấy có một cánh cửa khác phát lộ, men theo đó cô thấy một cánh cổng dẫn vào miệng Báo, có lẽ đây là lối đi mới mà Jonah và cô bạn mới quen phát hiện ra sau khi Lara rời đi. Mắt bạc chính là thứ làm nữ thám hiểm Lara Croft chú ý vì có thể chiếc Rương sẽ nằm ở đây. Khi đi qua hai thử thách Nhện và Đại bàng, cô nhận ra dấu vết của những kẻ tới trước. Vượt qua hết cả hai thử thách, Lara phát hiện một cậu bé đang bị trói chân đang vật lộn tìm đường thoát. Một tên ăn mặc dị hợm lao tới tấn công cả hai. Lara nhận thấy biểu tượng của Trinity trên trang phục của hắn và quyết định giúp cậu bé. Bất ngờ, mẹ cậu bé đến và đưa cả hai đến chỗ của bà. Những người này dường như không hoan nghênh người ngoài biết đến sự tồn tại của mình nên họ bịt mắt Lara và đưa đi, khác hoàn toàn với cách đối xử với người đã cứu con mình.
Khi đến nơi, người mẹ, đồng thời là thủ lĩnh của nhóm người lạ mặt được gọi tên là Unuratu tra hỏi Lara lý do cô đến đây, cô có can dự gì với bọn Cuồng Tín Kukulkan – Trinity. Cô thành thật trả lời rằng cô muốn ngăn cản bọn chúng có được chiếc hộp vì chúng quá nguy hiểm. Cô cũng hỏi lại vị nữ thủ lĩnh nơi này là đâu và vị trí của Rắn Mắt Bạc. Bà ta nói rằng nơi này là Paititi, hay còn được gọi là Thành phố Ẩn, và nơi mà cô muốn đến thì có đi mà chả có về. Thế nhưng, Lara vẫn muốn ngăn chặn Trinity không cho chúng tiếp cận chiếc hộp. Sự kiên định của nữ thám hiểm làm Unuratu cảm thấy thú vị và vì thế cũng có phần tin tưởng cô gái lạ mặt này một chút, tuy nhiên bà vẫn không hoàn toàn đặt niềm tin cô.
Vị trưởng làng cho Lara và Jonah gặp lại nhau. Họ đã mất liên lạc từ lúc nữ thám hiểm nhà Croft bước chân vào Thành phố Ẩn. Bà cũng sẽ dẫn Lara đến chỗ cô cần đến, nhưng Jonah phải ở lại để đảm bảo cô không chém gió về những gì cô nói. Cả hai đi vào làng, và Lara biết được bí mật của Tiến sĩ Dominguez, về thân phận mà gã giấu kín. Dominguez tên thật là Amaru, là một người con của Paititi. Nhưng hắn lại lớn bên ngoài nơi này, và giờ đây trở về truyền bá tham vọng của hắn. Người dân ở đây ai cũng tin hắn, chỉ có Unuratu và người của bà thì không. Khi Sayri, chồng của Unuratu và cũng là anh em của Amaru – Dominguez, mất thì Amaru quyết định hiến thân mình cho Cuồng Tín và trở thành thủ lĩnh của Trinity. Giờ đây, hắn quay về, với đủ sức mạnh và công nghệ để thực hiện dã tâm của mình. Niềm hy vọng cuối cùng của Paititi và Lara chính là chiếc hộp.
Bỗng Hakan, một người trong làng, nổi máu điên đòi tấn công Amaru, Unuratu đành ở lại tìm cách dàn xếp nên để cậu con trai của mình dẫn Lara đến chỗ Rắn Mắt Bạc. Khi thâm nhập vào trong, mùi tử khí ập lên tận mũi làm nữ thám hiểm choáng váng. Tuy không kinh dị như hồi ở đảo Nữ Thần, nhưng xác người bị cắt nham nhở, lăn lóc khắp nơi không thể không khiến người ta buồn nôn. Đây cũng là nơi mà bọn Cuồng Tín hiến tế người cho Kukulkan. Giải được thử thách tại đây, Lara tìm thấy một bức tượng rắn bạc khá khó hiểu, có lẽ là thứ gì đó mà Trinity không để ý đến. Khi quay trở lại Làng, cô và cậu nhóc bị bọn Cuồng Tín tấn công. Lara may mắn thoát được nhưng lại không kịp cứu lấy cậu nhóc. Cô đành quay lại với nhóm của mình để tìm cách. Unuratu đang lên kế hoạch giải thoát cho cậu bé thì nhìn thấy thứ mà Lara tìm được. Đó là chìa khóa của ngôi đền nằm trong núi, và đó là lý do bọn Kukulkan lại chiếm đóng khu vực đó làm căn cứ.
Cả hai quyết định chia ra: Lara sẽ lẻn vào trong, “dọn dẹp” đường để Unuratu và người của bà có thể tiến vào trong để giải cứu Etzli. Về cơ bản mọi thứ đều diễn ra đúng kế hoạch, chỉ là nữ thám hiểm phải bỏ Unuratu ở lại. Bà cũng không mong Lara giải cứu mình mà hãy tiếp tục hành trình của mình. Trước mặt Lara là một thác nước lớn, phía bên kia là một đường dẫn đến một phế tích cũ kỹ. Bỗng Lara bị tấn công bởi một đám người vô cùng quái dị. Hình dáng của chúng giống con người, nhưng lại không giống con người. Bọn chúng cũng không nói tiếng người mà chỉ tru lên những tiếng kêu the thé cực kỳ chói tai. Với nhiều điểm tương đồng về hình dáng, có thể khẳng định bọn người này chính là những kẻ đã tấn công bọn Trinity trong khu vực đào bới tại Kuwaq Yaku. Bọn chúng săn đuổi cô ráo riết vì dám xâm phạm đến nơi linh thiêng. Đây cũng là nơi mà cô gặp mặt với thủ lĩnh của chúng, theo dáng hình thì là một phụ nữ, với vương miện vàng trên đầu.
Bất ngờ nhất là bọn họ chỉ đứng đó nhìn, chứ không hề bước vào khu vực sau cánh cổng. Điều này chính Lara còn ngạc nhiên nhưng sau đó cô liền hiểu ra. Những người này là những người canh giữ chiếc hộp, không để nó lọt ra bên ngoài. Và nơi canh giữ chiếc hộp là nơi rất thiêng liêng nên bọn họ sẽ không một ai bước chân vào đó. Thế nhưng sự tình còn phức tạp hơn nhiều khi Lara phát hiện chiếc hộp đã không còn nằm ở vị trí đó nữa. Không phải cô, cũng không phài Trinity, vậy thì ai đang giữ chiếc hộp? Muốn trả lời hết những câu hỏi đó, trước tiên Lara phải chạy thoát khỏi cơn thịnh nộ của bọn người kia đã.
Lúc này, Jonah và những người còn lại đang lên kế hoạch giải cứu nữ hoàng Unuratu. Nữ thám hiểm lại nhận nhiệm vụ tiên phong, tìm cách giải thoát nữ hoàng trong êm thấm. Unutaru bị giữ trên đỉnh cao nhất của căn cứ Cuồng Tín, bà đang có một cuộc tranh cãi lớn về những hành động của Tiến sĩ Dominguez. Bà ra sức giải thích cho hắn việc hắn làm, trong khi gã Tiến sĩ tìm cách chiêu dụ bà làm việc cho hắn. Với sự kiên định của một người thủ lĩnh, bà dù có chết vẫn sẽ không muốn liên can tới hắn và Trinity, Hắn tiết lộ cho bà biết chiếc hộp mà bà ra sức bảo vệ không còn nằm ở nơi mà nó vốn thuộc về nữa. Hơn bốn trăm năm trước, có một kẻ đã thành công đột nhập vào nơi đó, cướp lấy chiếc hộp và giấu nó đi. Tên hắn là Andres Lopez và tất cà công sức của Unuratu đến bây giờ trở nên công cốc. Điều đó thật sự đánh gục niềm tin của bà. Bà gần như đã bỏ cuộc và Lara đành hỏi bà về nguồn gốc của những hình xăm trên người. Cô đã thấy nó được khắc họa bên trong nơi cất giấu chiếc hộp và đó là manh mối duy nhất mà cô có. Đó là hình ảnh về Xích Hỏa của Chak Chel và biểu tượng của Sinchi Chiqa, vị Hoàng đế cuối cùng của Paititi. Hai thông tin đó dẫn cả hai đến với mộ của Hoàng Đế để tìm chút manh mối. Lara tìm thấy Trái Tim của con rắn nằm trong ly, nhưng chưa tìm được gì thêm thì Trinity lại tấn công. Unuratu tử trận khi cố ngăn cản bọn Kukulkan và cậu bé Etzli trở thành thủ lĩnh kế vị của bộ tộc. Hành trình của nữ thám hiểm tại Paititi đã kết thúc, Lara quyết định trở ra ngoài tìm thêm manh mối về nơi cất giấu chiếc hộp, cô và Jonah rời đi trên thuyền với sự đưa tiễn của tân vương Etzli, cậu bé cũng có một cuộc chiến riêng phải lo.
Trên đường trở về Kuwaq Yaku, cô và Jonah bị phục kích đánh chìm thuyền và lạc mất nhau. Sau đó, Rourke liên lạc với Lara và hắn luôn mồm nói về việc cô đã làm, về bao nhiêu người cô đã hại chết. Hắn còn khiêu khích cô khi nghe lỏm kênh liên lạc của Jonah và bảo rằng Jonah đã chết, muốn lấy xác anh ta hãy tìm đến khu nhà máy lọc dầu bên kia sông. Tất cả là do lỗi của cô, Lara tiến về nhà máy lọc dầu và rơi vào thiên la địa võng của Trinity. Cô bị rượt đuổi, bắn rocket khiến cô văng xuống sông, sư phẫn nộ của nữ thám hiểm đã tới giới hạn. Cô trồi lên từ dòng nước cháy đỏ rực xăng dầu như một thiên thần sa ngã và đồ sát hết tất cả người của Trinity có mặt tại đó, bắn rơi chiếc trực thăng quân sự khiến Rourke hoảng hốt bỏ chạy vất lại lệnh rút lui "giả cứng" và khu lọc dầu chìm trong biển lửa. May mắn thay, Jonah xuất hiện cho thấy tên Rourke chỉ nói dối nhằm dụ Lara vào bẫy, nhưng cả hai cũng chả biết phải làm gì kế tiếp. Lara thật sự không hề biết địa điểm phải tới kế tiếp là đâu. Cuộc tìm kiếm của cô rơi vào ngõ cụt hoàn toàn.
Tags:
