Sau cái chết của Booker, cốt truyện Bioshock Infinite – Burial at Sea được chuyển sang Elizabeth với những diễn biến mới ngày càng rối rắm và xoắn não.
Cốt truyện Bioshock Infinite được tiếp nối với một phần DLC đặc biệt mang tên Burial at Sea kể về một câu chuyện liên quan đặc biệt đến thế giới trong game.
Cốt truyện Bioshock dẫn dắt người chơi xuống thành phố dưới đáy biển Rapture, nơi đang hỗn loạn bởi cuộc nội chiến cùng những tranh giành và âm mưu đen tối.
Câu chuyện của thành phố Columbia trong cốt truyện Bioshock Infinite bắt đầu rất lâu trước khi Booker xuất hiện và liên quan mật thiết đến Comstock, Lutece.
Cốt truyện Bioshock Infinite kể về một kẻ phàm trần Booker Dewitt lưu lạc trên thành phố bay Columbia và sau cuộc hành trình đó, thành phố bị hủy diệt.